Inför Linnéjubileet 2007 påbörjade Uppsala universitet och Uppsala kommun ett samarbete kring Uppsala Linneanska Trädgårdar. Uppsala kommun har åtagit sig att delfinansiera verksamheten mot att Botaniska trädgården, Linnéträdgården och Linnés Hammarby hålls öppet och tillgängligt för allmänheten.
Målet för samarbetet är att hålla det unika arvet efter Carl von Linné levande och samtidigt utveckla anläggningarna till attraktiva och välbesökta miljöer.